RNA组分分析作为许多不同工作流程的重要环节,包括但不限于⻝品检测和代谢组学研究。
这类分析的挑战之⼀是它们的极性较强,而且结构相似。
可以使用反相LC,但通常需要离⼦对试剂增加保留,而使用离子对试剂时需要很长时间才能在系统中达到平衡,使分析工作更加复杂。
今天小编就给大家介绍一个分离核酸碱基、核苷、核苷酸及磷酸核糖等13种RNA组分的HILIC方法。
图1. 核酸碱基、核苷和核苷酸的分析物结构。
LC系统:配备四元溶剂管理器的ACQUITY Premier系统
MS系统:Xevo TQD
色谱柱:规格均为2.1x50 mm
ACQUITY UPLC BEH Amide(货号:186004800)
Atlantis Premier BEH Z-HILIC(货号:186009978)
其它品牌A:HILIC-Z
其它品牌B:Polar X
样品瓶 :LCMS TruView zui大回收样品瓶(货号:186005668CV)
流动相A:水
流动相B:乙腈
流动相C:200 mM甲酸铵(pH 3.0)
梯度表:
柱温:50 °C
图2. 13种RNA组分在四种不同的HILIC固定相上的分离结果(1.尿嘧啶;2.腺嘌呤;3.腺苷;4.尿苷;5.胞嘧啶;6.⻦嘌呤;7.胞苷;8.⻦苷;9.单磷酸腺苷;10.单磷酸尿苷;11.磷酸核糖;12.单磷酸胞苷;13.单磷酸⻦苷)。
本次实验中使用的四支色谱柱,除BEH Amide外,其余均为两性离子或混合模式的色谱柱,由上图可见,它们在RNA分析物保留和选择性方面存在差异。
只有Atlantis Premier BEH Z-HILIC色谱柱能使所有化合物实现分离,而在其他色谱柱上至少均出现⼀组共洗脱化合物。
虽然Xevo TQD也可以检出这些化合物的峰,但更好的分离度便于对这些物质进行更好地积分和表征。
Atlantis Premier BEH Z-HILIC色谱柱采用的MaxPeak高性能表面(HPS)硬件可减轻磷酸化合物与色谱柱金属表面间的次级相互作用。
在某些条件下,这些金属和分析物的相互作用会导致峰形差异,甚⾄可能导致样品损失。
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