7月18日,美国国家航天航空局(NASA)将往国际空间站(ISS)运送下一批物资及科研设备,其中括含牛津大学的MinIon纳米孔测序设备。空间站的宇航员将利用其对**,病毒及小鼠的DNA进行测序,并将这些数据将传送回来,与地球上测得的结果进行比对。
MinIon纳米孔测序仪
约翰逊航天中心的微生物学家Sarah Wallace认为,目前来说,MinIon是**一个可以放心在宇宙空间使用的测序仪。她告诉记者,仪器的大小是它的优势之一,而且和Illumina以及Sanger法测序仪器不同的是,MinIon对于震动不敏感,另外耗电量也较小。
虽然,人们想对更多的微生物进行测序,但是MinIon在微重力的环境下工作的可靠性还需要进行确认。其中一个担忧是样品放入机器时会产生气泡,虽然这在地球上并不是什么大问题。放置样本的这一过程设计需要考虑到与航空工作环境相兼容。NASA还希望该系统可以满足在ISS上分析测序数据的需求。
Wallace希望MinIon在ISS的研究可以为地球上的研究者所用。ISS作为一个国际性的实验室, 如果这项研究可以进行, 那么该研究成果可以与整个学术界共享。
MinIon测序仪的其它应用
MinIon测序仪还有其他应用,Wallace的同事Aaron Burton一直在尝试着使用MinIon来探测其它星球。因为它与其它测序仪完全不同的工作机制,它可以主动寻找DNA,RNA和蛋白质,如果对纳米孔进行修饰,也许可以通过它来寻找不同种类的核酸。
Burton 说:“在我所了解的技术中,这是**一个可以用来寻找未知的仪器,我可以利用它找出一个样本中所有的**,而不像PCR,我需要知道特异性的引物,然后去寻找已知的序列。这项技术刚好满足了我们寻找未知序列的要求。”
NASA工作计划
NASA计划于7月18日将MinIon运往NASA极端环境任务操作间(NEEMO),这是一个水下工作站,位于弗罗里达Key Largo海岸线上。在这个模拟的宇宙工作站中,研究者和工程师也会进行同样的测序实验。其余科学家已经为在宇宙空间站的实验做好准备,确保仪器在空间站的工作与在地球一样。
Bruce Hammer是明尼苏达州中心大学磁共振研究所的教授,他曾建议开展针微重力环境下骨小体的组学研究。在NASA的电话会议上Hammer教授说,他们将会对7月18日运送到ISS的骨小体样本进行基因表达,蛋白表达,两种表达之间的关系以及骨小体新城代谢水平的研究。这项研究预计将于九十月份开始,宇航员会先解冻这些细胞。一旦该实验开始,他和他的同事将会对在ISS上得到的数据与地球上模拟微重力环境下得到的数据进行对比。
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